Die Aufgaben der Abteilung Gesundheitsamt umfassen den Amtsärztlichen Dienst und Sozialpsychiatrischen Dienst, die Gesundheitsberatung, den Bereich Hygiene sowie den Kinder- und Jugendärztlichen Dienst und den /Kinder- und Jugendzahnärztlichen Dienst.

Das Referat Amtsärztlicher Dienst erstellt amtliche Gutachten und Zeugnisse, die durch Gesetz, Rechtsverordnung oder bindende Verwaltungsvorschrift gefordert sind, sowie Gutachten für Entscheidungen der öffentlichen Verwaltung oder der Gerichte. Zu den Aufgaben gehören außerdem die Medizinalaufsicht und -statistik, das Leichen- und Bestattungswesen, die Mortalitätsstatistik und Aufgaben nach dem Masernschutzgesetz. Es werden Medikamentenmitnahmebescheinigungen gemäß Betäubungsmittelgesetz sowie Impfduplikate ausgestellt und ärztliche Meldungen über Impfkomplikationen bearbeitet. Zudem kann sich jeder Bürger des Landkreises zum Thema Impfen beraten lassen.

Die Ambulante Krebsberatungsstelle bietet umfassende psychosoziale Beratung und Unterstützung für an Krebs erkrankte Personen und Ratsuchende. Die kostenfreien Beratungen können für immobile Betroffene auch in aufsuchender Tätigkeit erfolgen.

Der Sozialpsychiatrische Dienst (SpDi) ist ein niederschwelliger, d. h. ein allen offenstehender und leicht zugänglicher ambulanter Dienst für Menschen mit psychischen Erkrankungen oder in seelischen Krisen. Angehörige und Institutionen können sich ebenso kostenfrei beraten lassen. Herausstellungsmerkmale des SpDi sind die aufsuchende Tätigkeit und die Lotsenfunktion bei der Koordinierung von Hilfen.

Dem Referat Hygiene obliegt die Überwachung der Qualität von Trink- und Badewasser, die Probeentnahme von Trink- und Badewasser sowie die Überwachung der Wasserqualität von Hausbrunnen. Weitere Aufgaben sind die Überwachung der Einhaltung von Hygienevorschriften in Kliniken, Arztpraxen, Alten- und Pflegeheimen, Frei- und Hallenbädern, Saunen, Gemeinschaftseinrichtungen. Neben der Beratung bei gesundheitlichen Problemen durch Umwelteinflüsse ist das Referat auch für die Erfassung und Bewertung meldepflichtiger Krankheiten (Infektionen): Umgebungsuntersuchungen, das Einleitung und Durchführung antiepidemischer Maßnahmen, Tuberkuloseüberwachung und  -bekämpfung, Belehrung und Bescheinigung nach §§ 42, 43 Infektionsschutzgesetz (Beschäftigte bei Herstellung und Inverkehrbringen von Lebensmitteln) zuständig.

Das Referat ist zuständig für die ärztliche Untersuchungen zur Früherkennung gesundheitlicher Störungen: Screening der Kindergartenkinder zwei Jahre vor der Einschulung, Einschulungsuntersuchungen, Schuluntersuchungen an Grund-, Ober- und Förderschulen und an Gymnasien, Untersuchung von Kindern vor der Aufnahme in Förderschulen, Begutachtungen von Sporttauglichkeit sowie der Impfstandskontrolle und Durchführung von Schutzimpfungen nach den Empfehlungen der Sächsischen Impfkommission. Außerdem werden entwicklungsgefährdete und behinderte Kinder im Rahmen der Eingliederungshilfe begutachtet. Weitere Aufgaben sind die jugendzahnärztliche Reihenuntersuchungen bei Kindern ab Besuch der Kindereinrichtung bis einschließlich Klassenstufe 7 und bei Einrichtungen mit erhöhtem Kariesrisiko bis Klassenstufe 10 sowie die Durchführung und Koordination gruppenprophylaktischer Maßnahmen einschließlich Mundhygieneerziehung, Ernährungsberatung, Aufklärung zur Kariesprophylaxe. Daneben erfolgen gutachterliche Tätigkeiten, Gesundheitsberichterstattung und Öffentlichkeitsarbeit.